疾病一直是影响鸡苗发展的重要因素，比如大家所熟悉的禽流感，新城疫，寄生虫病等，这些疾病都会对鸡苗造成毁灭性的打击，尽管现在科学如此发达，但是面对一些鸡苗疾病，科学家还是束手无策，这更增加人们对鸡苗疾病的担忧。鸡苗
既然不能完全治疗，那么最好的便是做好预防工作，导致鸡苗患病的无非就两大因素，一个是鸡苗自身的原因，而另外一个则是来自环境的污染， 鸡苗厂家认为，只要做好以下五项防范措施，便可确保鸡苗安然无恙了。
1 存在免疫空白
规模化（适度规模）鸡场平时只重视新城疫、禽流感和鸡传支等重点疫病的免疫接种，在未出现批量发病的线虫和球虫病之前，往往不重视预防寄生虫病。秋冬季鸡群罹患任何一种寄生虫病皆可导致各类高发病，加速传播、扩大感染及致死率，建议鸡场进鸡后于1 月龄、2 月龄和4 月龄时有计划地采用抗寄生虫制剂进行预防性驱虫，使用广谱性的伊维菌素或阿维菌素拌料口服效果较好。针对性预防线虫，以抗蠕敏、盐酸左旋脒和丙硫脒较好。视诊个别幼龄患鸡粪便带血应疑为鸡球虫，应使用有效的抗球虫制剂对症防控。
2 鸡群结构不合理
鸡场未严格坚持全进全出制，本批次鸡群中混养上一批次的隐性感染鸡，或几代同室、老幼混养和不同禽类混养等，均可加大该疾病感染及发病几率；隐性感染个体排出的粪便污染环境或与健康鸡群接触，造成直接或间接的传染。建议严格执行全进全出制，特别是有寄生虫病史（线虫、螨虫和原虫等）的鸡场，全出后将可能被污染的粪污和垫料等彻底清除， 并对饲养环境和用具认真冲洗，经过3～5 次规范化消毒， 坚持3 个月以上的休养期，能够有效降低球虫病再感染的几率。定期清除鸡舍内的粪尿及垫料， 并用10%生石灰澄清液或3%来苏尔液实施消毒灭源，及时杀灭寄生虫卵。
3 存在中间传播媒介
鸡场内随意进入无关人员、犬、猫和其他野禽等，包括鸡群接触、食入中间宿主甲虫、苍蝇、蜘蛛、蜗牛、蚂蚁和蚯蚓等，也可造成间接性寄生虫感染。建议鸡场内严禁饲养犬、猫等其他畜禽，禁止无关人员及车辆等随意进入， 设置挡网防控野禽进入，重视消灭鼠害，加强所有外来疫源防范。严防饮水及饲料被污染而造成食入性传染；及时清除鸡舍内低洼处蓄积的污水和粪尿，消除蚊蝇、蚯蚓等中间宿主滋生的适宜环境，尽量减少鸡群与其接触。
4 饲养管理缺陷
秋冬季饲养人员容易疏懒，自我保洁和生物安全防疫方面往往做得不够，鸡的饲料营养供应不均衡等，极易导致寄生虫病的发生。建议秋冬季养鸡要长期保持饲料、饮水清洁，料槽、水槽和笼具等定期消毒，每周至少1～2 次，消毒方法可采用煮沸消毒、热蒸汽消毒或3%～5%热碱液浸泡消毒等。球虫病是秋冬季高危害性、重点防范的病种，建议用球虫灵和1:200 倍的农乐溶液整场消毒，包括运动场也要喷施到位，可杀灭本场内大量包括球虫卵在内的多种寄生虫卵。日粮添加s（硒）025～05，可有效增强鸡群抗球虫能力。个别雏鸡出现血痢现象疑为球虫病，应整群倍量投喂vk、va 和vc，可增强鸡群抵抗力，还能加速患鸡痊愈。
5 养殖环境不良
秋冬季气温逐渐降低，饲养者容易产生管理懈怠，未及时抓好鸡舍内环境卫生管理，久之鸡舍内变得阴冷潮湿、卫生条件恶劣，形成了病毒性疾病流行的温床。日常疏于消毒灭源和饲养管理不善等，很容易诱发鸡球虫病和线虫病。高密度饲养的规模化鸡场， 秋冬季如果关闭门窗保温时间过久，鸡舍内升温较快，加之粪尿清理不及时，温暖、潮湿的环境非常有利于寄生虫卵的繁衍和增殖。建议秋冬季应提前修缮鸡舍，以利于舍内实施主动控温、通风和排湿。一是在外界温度急剧下降（昼夜温差超过5℃）的情况下，关闭鸡舍门窗保温，雏鸡舍保持适宜温度为28～30℃、相对湿度655%，育成鸡舍保持适宜温度为20～25℃、相对湿度705%；二是适时开门窗排湿，秋冬季遇到风、霜、雨、雪等不利天气，需要关闭鸡舍门窗保温，但是长期关门闭户也有弊端，可能造成某些寄生虫开始繁衍。排湿要领是打开鸡舍背风向阳门窗透气， 每天3～4次，每次10～20 分钟，坚决勿令冷风直吹鸡群，也不能让贼风穿舍，造成鸡群冷应激；三是及时清除舍内粪尿、被污染垫料等有机物，再行消毒以提高消毒实效和减少寄生虫繁衍增生的机会，清理掉的有机物要实施无害化处理，防止虫卵在场内再扩散。
虽然有些疾病，仅凭如今的医学手段还无法做到完全治愈，不过养殖户也无需惊慌，只需做好各种疾病的预防工作，便可有效地防止鸡苗患病，从而大大节省养殖成本，为广大消费者提供更多绿色健康的食品。
鸡苗的疑难杂症很可能是由垫料引起的